​La Pastoral del colegio Madre Paulina tiene como misión contribuir a hacer de cada integrante de la comunidad educativo-pastoral una persona que acoja, encarne y manifieste el amor gratuito de Dios, bajo el modelo inspirador de Madre Paulina Von Mallinckrodt, que tiene como centro de su vida a Jesús Eucaristía y el ejemplo de María Inmaculada en sus virtudes características, en especial el servicio desinteresado a los demás.

Para la concreción de este proyecto se establecen cuatro áreas del desarrollo de la fe, a saber: profética, comunitaria, litúrgica y solidaria; para cada una de ellas se desarrollan diversas actividades tales como, Misas comunitarias, grupos pastorales y catequesís, oración diaria, visitas fraternas, entre otras. Esta tarea, que involucra a todos y cada uno de los miembros de la Comunidad Educativa Pastoral.​